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Enteropathway


Enteropathwayはヒト腸内細菌に特化した機能アノテーションデータベースです。
腸内細菌が関連する代謝経路を論文から手動でキュレーションしたデータを集約、800以上の機能単位(アノテーション)を含み遺伝子や代謝物の関係を探索することが可能です。代謝経路はカスタマイズ可能なweb UI上にまとめられています。

JMDB

大腸がん患者から得られた腸内細菌叢や腸内の状態、患者情報などの大量のデータを管理しています。データ利用を希望されるかたは以下のフォームにご入力お願いします。
入力フォームは こちら
引用データ元:https://www.nature.com/articles/s41591-019-0458-7

FuncTree2

FuncTree2では生物がもつ代謝機能を階層的なカテゴリに分類し、それをツリー状に可視化します。これにより、一遺伝子から細胞のレベルに至るまでの幅広い解像度で、対象のサンプルがもつ代謝機能を効率的に俯瞰することを可能にしました。
https://bioviz.tokyo/functree2/

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