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EnteroPathway

EnteroPathway は、腸内細菌特有の代謝経路をまとめたデータベースです。実験で取得した腸内細菌叢の様々なデータを多角的な視点で捉えることで、新たな知見を得られると考えています。

JMDB

大腸がん患者から得られた腸内細菌叢や腸内の状態、患者情報などの大量のデータを管理しています。データ利用を希望されるかたは以下のフォームにご入力お願いします。
入力フォームは こちら
引用データ元:https://www.nature.com/articles/s41591-019-0458-7

FuncTree2

FuncTree2では生物がもつ代謝機能を階層的なカテゴリに分類し、それをツリー状に可視化します。これにより、一遺伝子から細胞のレベルに至るまでの幅広い解像度で、対象のサンプルがもつ代謝機能を効率的に俯瞰することを可能にしました。
https://bioviz.tokyo/functree2/

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